SOMA2 1.4.1 Aluminium julkaistu

01.06.2012

Tutkijan käyttöliittymän SOMA2-asennus on myös päivitetty uusimpaan versioon ja muutettu käyttämään sovelluksia Vuori-klusterilla kohta käytöstä poistettavan Murska-klusterin sijasta.

SOMA2 on WWW-selaimella käytettävä työvuoympäristö molekyylimallinnusta varten. SOMA2 on kehitetty CSC - Tieteen Tietotekniikan Keskus Oy:ssä. SOMA2 1.4.1 Aluminium julkaistiin 31. Toukokuuta 2012. SOMA2 ohjelmisto on julkaistu avoimen lähdekoodin lisenssillä (GNU General Public License). Ohjelmiston lähdekoodi, dokumentaatio, ja muu oheismateriaali on saatavissa osoitteesta:

http://www.csc.fi/soma

Versio 1.4.1 Aluminium lisää tuen grid-laskentaa ja grid-varmenteiden hallintaa varten sekä tuo parannetun käyttöliittymän työvoiden konfigurointiin. Lisäksi mukana on monia muita parannuksia ja korjauksia ohjelmistoon. Suora linkki julkaisutietoihin:

http://www.csc.fi/english/pages/soma/downloads/soma2/CHANGES.txt/view

CSC:n asiakkaille SOMA2 1.4.1 Aluminium on nyt myös käytettävissä Tutkijan käyttöliittymän kautta osoitteessa:

https://sui.csc.fi

SOMA2 tarjoaa monipuolisen mallinnusympäristön aina molekyylien syöttämisestä tulosten analysointiin saakka. Systeemi hyödyntää laskentaympäristöön asennettuja tieteellisiä ohjelmistoja. SOMA2 ympäristö tarjoaa helppokäyttöisiä WWW-liittymiä ohjelmien konfigurointiin ja ajamiseen. Tieteellisiä ohjelmistoja voidaan myös saumattomasti kytkeä työvoiksi, joissa useita eri ohjelmistoja suoritetaan automaattisesti peräkkäin. SOMA2-järjestelmään on helppo liittää uusia työkaluja ja järjestelmä on siirrettävissä myös paikalliseen laskentaympäristöön. Tutkijan käyttöliittymän SOMA2-asennuksen kautta voi käyttää Hipulle ja Vuorelle asennettuja ohjelmistoja. Näitä ohjelmistoja ovat muun muassa AutoDock, Gaussian, GOLD, GPAW ja TURBOMOLE. Lisäksi SOMA2 tarjoaa mahdollisuuden hyödyntää FGI:n (Finnish Grid Infrastructure) tarjoamia laskentaresursseja valikoiduissa ohjelmissa. SOMA2-ohjelmiston grid-tuki on kehitetty osana EGI-InSPIRE-projektia (http://www.egi.eu/about/egi-inspire/), jossa CSC on mukana.