Tehdyt toimenpiteet
Euroopan kattava bioinformatiikan infrastruktuuri rakenteilla – Suomi allekirjoitti ELIXIR-aiesopimuksen
13.09.2011
Suomi on allekirjoittanut ELIXIR-aiesopimuksen. ELIXIR (European life science infrastructure for biological information) on muodostamassa koko Euroopan kattavaa bioinformatiikan tutkimusinfrastruktuuria. Aiesopimuksen ovat allekirjoittaneet myös Tanska, Ruotsi, Iso-Britannia, Alankomaat sekä Euroopan molekyylibiologian laboratorio (EMBL).
Opetusneuvos Marja-Liisa Niemi allekirjoitti ELIXIRiä koskevan aiesopimuksen opetusministeriön valtuuttamana Helsingissä 8. heinäkuuta 2011. Allekirjoittaneet maat ovat edustettuina ELIXIRin väliaikaisessa hallituksessa, joka neuvottelee ELIXIRIn lopullisesta hallintomallista.
ELIXIR aloittaa neuvottelut ELIXIR-infrastruktuurin muodostamisesta ja siihen liittyvistä palvelusopimuksista kuuden tahon allekirjoitettua aiesopimuksen ELIXIRin eurooppalaisen viranomaisorganisaation EMBL:n kanssa. Suomi allekirjoitti sopimuksen ensimmäisten maiden joukossa.
Suomessa ELIXIR on osa kansallista Biomedinfra-hanketta, joka rakentaa kokonaisuuden biopankeista saadun geenitiedon analysoimiseksi ja hyödyntämiseksi. Yhteistyö toteutetaan Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen (THL), Suomen molekyylilääketieteen instituutin (FIMM) ja CSC – Tieteen tietotekniikan keskuksen yhteistyönä kolmen europpalaisen biolääketieteen infrastruktuurihankkeen puitteissa: Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure (BBMRI), European Advanced Translational Research Infrastructure in Medicine (EATRIS) ja European Life Science Infrastructure for Biological Information (ELIXIR).
”Eurooppalaisen tutkimusinfrastruktuuri ELIXIRin rakentaminen tukee opetus- ja kulttuuriministeriön keskeisiä tavoitteita tutkimusympäristöjen kansainvälistämiseksi ja tutkimuksen laadun parantamiseksi sekä innovaatioitoiminnan edistämiseksi”, kertoi opetusneuvos Marja-Liisa Niemi.
Vuosina 2010–2011 Biomedinfra-hanke sai Suomen opetus- ja kulttuuriministeriöltä rahoitusta yhteensä viisi miljoonaa euroa Suomen Akatemian kautta. Lisärahoitusta saatiin Biomedinfra-konsortioon kuuluvilta tahoilta (CSC, FIMM ja THL) vuosina 2010–2011 yhteensä 1,85 miljoonaa euroa. Myös Iso-Britannia, Ruotsi, Tanska ja Espanja ovat myöntäneet kansallista rahoitusta ELIXIR-hankkeelle.
CSC:llä on vahva asema ELIXIRin laskentainfrastruktuuriverkostossa.
”Biotieteellisen datan prosessoinnin avulla Suomi haluaa vahvan roolin ELIXIRin laskentainfrastruktuuriverkostossa”, kommentoi Tommi Nyrönen CSC:ltä.
”ELIXIR on keskeinen infrastruktuurihanke Suomen bio- ja lääketieteellisen tutkimuksen kannalta. Eräs suurimmista haasteista jatkossa on eksponentiaalisesti lisääntyvä biologisen tiedon määrä ja tiedon hyödyntäminen. ELIXIR-verkosto, CSC ja kansallinen Biomedinfra hankekokonaisuus tähtäävät infrastruktuurin ja osaamisen kohentamiseen Euroopassa ja Suomessa, jotta tutkimustoiminnan tuottamasta tiedosta saadaan kaikki hyöty irti”, sanoi FIMMin johtaja, professori Olli Kallioniemi.
ELIXIR rakennetaan hajautettuna infrastruktuurina, joka koostuu useista eri puolilla Eurooppaa sijaitsevista huippulaskentayksiköistä. Nämä nk. ELIXIR-solmut kytketään keskuspaikkaan, joka sijaitsee Euroopan molekyylibiologian laboratorion alaisessa Euroopan bioinformatiikkainstituutissa (European Molecular Biology Laboratory - European Bioinformatics Institute, EMBL-EBI) Hinxtonissa, Cambridgen eteläpuolella Englannissa.
Lisätietoja: Tommi Nyrönen, CSC, e-mail: tommi.nyronen(at)csc.fi, puh. 050 381 9511.
Katso myös: http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/uutiset/biomedinfra
http://www.csc.fi/english/csc/news/news/highcapacitydataconnectionforbiomedicine
http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/uutiset/bioinfraan_vauhtia_pilvesta
CSC - Tieteen tietotekniikan keskus Oy on voittoa tavoittelematon opetus- ja kulttuuriministeriön hallinnoima osakeyhtiö, joka tarjoaa korkeakouluille ja tutkimuslaitoksille tietoteknistä tukea ja resursseja: mallinnus-, laskenta- ja tietopalveluja. Tutkijat voivat käyttää Suomen laajinta tieteellisten ohjelmistojen ja tieteen tietokantojen valikoimaa sekä Suomen tehokkaimpia supertietokoneita Funet-tietoliikenneyhteyksien kautta.
