Suuritehoinen tietoliikenneyhteys biolääketieteelle

28.06.2010

Tieteen tietotekniikan keskus CSC ja Helsingin yliopiston Molekyylilääketieteen Instituutti (FIMM) ovat rakentaneet suuritehoisen tiedonsiirtoyhteyden Meilahden ja Otaniemen välille.

Tämä valopolku laajentaa CSC:n palveluiden lähiverkon Tutkimus- ja opetuskeskus Biomedicum Helsinkiin Meilahdessa.  Valopolku otetaan käyttöön Meilahden ja Otaniemen välillä 28.6.2010. Tämän jälkeen CSC:n palvelut kytkeytyvät saumattomasti FIMM:in tietotekniseen ympäristöön. Suuritehoisen tiedonsiirtoyhteyden (10 Gbit/s) lisäksi tietoliikenne CSC:n ja FIMM:in välillä on omassa verkossaan, jolloin saavutetaan tietoturvaetuja. Tulevaisuudessa tähän yhteyteen lisätään erilaisia resursseja, kuten tallennus- ja laskentakapasiteettia, jotka parantavat opiskelijoiden ja tutkijoiden työskentely-ympäristöä. Tietoteknistä infrastruktuuria ja palveluita kehitetään esimerkiksi biopankeista saadun geenitiedon analysoimiseen ja hyödyntämiseen.

Uusi valopolku on osa CSC:n ylläpitämää, Suomen korkeakouluja ja tutkimusta palvelevaa Funet-verkkoa.  Funet (Finnish University and Research Network) tarjoaa huippunopeat tietoliikenneyhteydet lähes 80 tutkimusorganisaatiolle ja yli 350 000 käyttäjälle.

Osa tulevaa biotieteen infrastruktuuria

Eurooppaan on syntymässä yhteiset tutkimusinfrastruktuurien ja palveluiden markkinat. Terveyden ja hyvinvoinnin laitos, Molekyylilääketieteen instituutti FIMM ja CSC - Tieteen tietotekniikan keskus pyrkivät yhdessä merkittävään rooliin kolmen eurooppalaisen tutkimusinfrastruktuurin kehittämisessä perustamansa keihäänkärkihankkeen Biomedinfra.fi’n kautta, jota rahoittavat Suomen Akatemia, Opetus- ja kulttuuriministeriö, ja Sosiaali- ja terveysministeriö. Näiden eurooppalaisten biolääketieteen infrastruktuurihankkeiden pääosa-alueet ovat biopankit (BBMRI), lääketieteellisen tutkimustiedon hyödyntäminen (EATRIS), ja biologiset tietoaineistot ja bioinformatiikka (ELIXIR).
Suomella on edellytykset Euroopan johtavan biolääketieteen tutkimusinfrastruktuurin kehittämiseen, koska Suomen toimintamallissa on löydetty keinot yhdistää kolmen erilaisen asiantuntijaorganisaation osaaminen.
”Dataintensiivinen yhteistyö ja resurssien jakaminen vaatii toimivan tietoteknisen alustan, jonka keskeinen osa on tehokas tietoliikenneverkko.  Vastaavaa palveluiden jakelureittiä voidaan tarjota tulevaisuudessa myös muille toimijoille,” kertoo kehityspäällikkö Tommi Nyrönen CSC:ltä.

Lisätietoja

Yhteyshenkilöt:

• FUNET: Kehityspäällikkö Juha Oinonen, CSC – Tieteen tietotekniikan keskus Oy, juha.oinonen at csc.fi, p. 050 381 9513
• Biopankit (BBMRI-infrastruktuurihanke):  Erikoistutkija Markus Perola, Terveyden ja hyvinvoinnin laitos, markus.perola at thl.fi puh. 040 861 2557
• Tutkimustiedon hyödyntäminen (EATRIS-hanke): Tutkimuskoordinaattori Imre Västrik, Suomen molekyylilääketieteen instituutti FIMM,  imre.vastrik at fimm.fi, p. 050 415 4451
• Biologiset tietoaineistot ja bioinformatiikka (ELIXIR-hanke): Kehityspäällikkö Tommi Nyrönen, CSC - Tieteen tietotekniikan keskus Oy, tommi.nyronen at csc.fi puh. 050 381 9511

Eurooppalaiset biolääketieteen tutkimusinfrahankkeet:

• BBMRI: Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure (biopankit) http://www.bbmri.eu
• EATRIS: European Advanced Translational Research Infrastructure in Medicine (tutkimustiedon hyödyntäminen) http://www.eatris.eu
• ELIXIR: European life science infrastructure for biological information (biologiset tietoaineistot ja bioinformatiikka) http://www.elixir-europe.org

CSC - Tieteen tietotekniikan keskus Oy on voittoa tavoittelematon opetus- ja kulttuuriministeriön hallinnoima osakeyhtiö, joka tarjoaa korkeakouluille ja tutkimuslaitoksille tietoteknistä tukea ja resursseja: mallinnus-, laskenta- ja tietopalveluja. Tutkijat voivat käyttää Suomen laajinta tieteellisten ohjelmistojen ja tieteen tietokantojen valikoimaa sekä Suomen tehokkaimpia supertietokoneita Funet-tietoliikenneyhteyksien kautta.