Professori Gunnar von Heijne (toimikausi 2006-2007)  Biokemian ja -fysiikan osasto (Tukholman yliopisto)
Professori von Heijne toimi CSC:ssä bioinformatiikan ja biotieteiden tieteellisenä neuvonantajana.

Professori Markku Kulmala (toimikausi 2005-2007) Ilmakehätieteiden laitos (Helsingin yliopisto)
Professori Markku Kulmala toimi ympäristötieteiden tieteellisenä neuvonantajana.

Professori Heikki Mannila (toimikausi 2006-2007) Tietojenkäsittelytieteen laitos (Helsingin yliopisto)
Professori Heikki Mannila toimi tietojenkäsittelytieteen ja tiedonlouhinnan neuvonantajana.

Professori Risto Seppälä (toimikausi 2007-2008) Metsäntutkimuslaitos
Professori Risto Seppälän aihealue CSC:n tieteellisenä neuvonantajana oli eri tutkimusalueiden ja sektoreiden metsiin ja metsien hyödyntämiseen liittyvä tutkimus.

CSC:n aikaisemmat neuvontajat vuodesta 2002

Professori Karsten W. Jacobsen www.fysik.dtu.dk/~kwj/

Professori Raimo Kantola www.tct.hut.fi/u/kantola/

Professori Janet Thornton www.ebi.ac.uk/Thornton/

Professori Risto Nieminen www.fyslab.hut.fi/

Professori Olivier Pironneau www.ann.jussieu.fr/