======================================================================
Chemistry@CSC - nro 1/2007

Sisällys:

0. Hyvää alkanutta vuotta 2007!
1. Uudet koneet
2. Tulevat kurssit ja tapahtumat
3. Ohjelmistouutisia
4. Tietokantauutisia


----------------------------------------------------------------------

0. Hyvää alkanutta vuotta 2007!

Uusi vuosi alkaa uusien koneiden odotustunnelmissa. Pahoittelemme 
tilapäistä laskentakapasiteetin vähenemistä, pian tilanne korjautuu. 

Kemian asiakastuessa kysymyksiin vastaa edelleen kolme kemistiä, 
Nino Runebergin ja Mikael Johanssonin vaihdettua kapulaa. 
Hyvää jatkoa Mikael! 
 
Talvisin terveisin, CSC:n kemian asiantuntijat
Johanna Blomqvist, johanna.blomqvist@csc.fi
    Nino Runeberg, nino.runeberg@csc.fi
   Atte Sillanpää, atte.sillanpaa@csc.fi
                   http://www.csc.fi/chem


-----------------------------------------------------------------------
 
1. Uudet koneet

CSC:n uusien superkoneiden Louhen (Cray XT4 superkone) ja Murskan (HP 
Opteron superklusteri) asentamisaikataulua voi seurata suoraan 
www-sivuiltamme:

  http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/superkoneen_kayttoonotto

Siirtymävaiheessa olemme joutuneet ajamaan vanhaa kapasiteettia
väliaikaisesti alas ennen kuin uusi saadaan käyttöön. Toivomme
kärsivällisyyttä Sepelin ja IBMSC:n käytön kanssa.

Louhi on saapunut ja käynnissä ja siihen asennetaan parasta aikaa 
sovelluksia.

-----------------------------------------------------------------------
2. Tulevat kurssit ja tapahtumat

*05.02.-06.02.2007
Sybyl training course

Ilmoittautumisaika on päättynyt, mutta jos olet kiinnostunut 
kurssista ota yhteyttä Johannaan.
Kurssilla keskitytään reseptori-ligandimallinnukseen ja aktiivisten 
ligandien suunnitteluun QSAR/CoMFA-menetelmillä. Kurssi on maksuton 
Sybyl-konsortion jäsenille.

http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/Sybyl_course2007

*05.03.- 08.03.2007
Cray Workshop for Louhi Users

Ilmoittautuminen 26.02.2007 16:00 mennessä.
Compiling and porting codes to Cray XT4. Profiling and optimization 
parallel codes, and usage of program development tools on Louhi. 
Includes hands-on work on participants own codes.

http://www.csc.fi/english/csc/courses/crayworkshop

*13.03.2007 - 14.03.2007
Finnish Supercomputing Days 2007

Ilmoittautuminen 26.02.2007 mennessä.
CSC organizes a two-day seminar on supercomputing. The focus of the 
seminar is on the current situation in Finland and on the future of 
the supercomputing in general. During these two days, the main 
scientific projects of high-performance computing in Finland and 
their Nordic countries will be presented. In addition, grand 
computational challenges for the future will be covered.

http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/FSD2007

-----------------------------------------------------------------------
3. Ohjelmistouutisia

3.1. 	Accelrys lisenssi uusittu vuoden vaihteessa ja lähetetty
        käyttäjille sähköpostitse. Jos lisenssi on kuitenkin hukassa,
        uuden saa pyytämällä sähköpostitse: atte.sillanpaa@csc.fi

3.2.	Turbomole 5.9 Sepelissä. Huom! 5.9-binäärit eivät toimi edustanoodissa.
    Käytä 'qrsh'-komentoa avataksesi interaktiivinen istunto laskentanoodissa
    esim. define-käyttöä varten. Turbomole-käyttäjiä varten on perustettu 
    uusi keskustelufoorumi osoitteessa http://www.turbo-forum.com/ .  

3.3.    NWChem 5.0 Sepelissä ja IBM:ssä.

3.4.    ADF 2006.01b Sepelissä ja IBM:ssä.

3.5.    Molpro 2006.1 patchlevel 52 Sepelissä.

-----------------------------------------------------------------------
4. Tietokantauutisia

4.1 	CSD 2.58 asennettu Coronaan
Uusista ominaisuuksista mainittakoon kiderakenteiden suora linkki
alkuperäisjulkaisuihin ja Accelrys Materials Studio -kytkös (paikallinen 
asennus) Loput uudet ominaisuudet löytyvät CCDC:n sivuilta:

http://www.ccdc.cam.ac.uk/support/documentation/csd/csds_release&installation_notes.pdf

CSD-tuotteiden esittely:

http://www.ccdc.cam.ac.uk/products/product_flyers/

-----------------------------------------------------------------------

SEURAAVA UUTISKIRJE ilmestyy viikolla 11.

----------------------------------------------------------------------