From asillanp@csc.fi Tue Apr 24 10:35:03 2007 Date: Tue, 24 Apr 2007 10:32:07 +0300 (EEST) From: Atte Sillanpää To: csc-kemia@postit.csc.fi Subject: [Csc-kemia] Chemistry@CSC - nro 3/2007 ====================================================================== Chemistry@CSC - nro 3/2007 Sisällys: 0. Hyvää vappua! 1. Uudet koneet 2. Tulevat kurssit ja tapahtumat 3. CSC rekrytoi 4. Apuraha- ja resurssihakuja 5. CSC:n lehdet ---------------------------------------------------------------------- 0. Hyvää vappua! Kevät tulee kovaa vauhtia. Ennen kesää CSC tarjoaa vielä tutkimuksen vauhdittamiseksi resursseja DEISAsta, kursseja ja apurahoja nuorille tutkijoille. Pohjoismaisia Grand Challenge -projekteja selvittänyt tutkimus on valmistunut. Lue alta mihin laskentakapasiteettia halutaan käyttää! http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/uutiset/laskennallsen_tieteen_haasteet_2007_3_19 Skumppaisin terveisin, CSC:n kemian asiantuntijat Johanna Blomqvist, johanna.blomqvist@csc.fi Nino Runeberg, nino.runeberg@csc.fi Atte Sillanpää, atte.sillanpaa@csc.fi http://www.csc.fi/chem ----------------------------------------------------------------------- 1. Uudet koneet 1.1 Louhi käyttöön 2.4. CSC:n uusi Louhi (Cray XT4 superkone) on otettu käyttöön 2.4. Toinen uusi superkone Murska (HP Opteron superklusteri) on jo asennettavana, ja asennusaikataulua voi seurata www-sivuiltamme: http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/superkoneen_kayttoonotto Hae tunnusta Louhelle ja osoita laskentakoodisi skaalautuminen! Testattuja koodeja on esitelty täällä: http://www.csc.fi/english/research/Computing_services/computing/servers/scalabilityresults Siirtymävaiheessa olemme joutuneet ajamaan vanhaa kapasiteettia väliaikaisesti alas ennen kuin uusi saadaan käyttöön. Toivomme kärsivällisyyttä Sepelin ja IBMSC:n käytön kanssa. 1.2. IBMSC poistuu käytöstä IBMSC-poistuu käytöstä kuluvan vuoden aikana. IBM Power SP4:n huoltosopimus on irtisanottu, mutta kone pyritään pitämään käytössä vielä kesän ajan. On silti mahdollista, että käyttö päättyy nopalla aikataululla. Käytön siirtämistä muille koneille kannattaa jo valmistella. ----------------------------------------------------------------------- 2. Tulevat kurssit ja tapahtumat 2.1 Fortran-kurssi 10-11.5. CSC:llä Kurssilla käydään läpi ohjelmointikielen perusteet CSC:n laskentaympäristöön sovitettuna. Kurssilla tehdään ohjatusti useita harjoitustehtäviä. Ilmoittautuminen ja lisätietoja: http://www.csc.fi/csc/kurssit/arkisto/fortran 2.2 PERCH NMR course 21.-22.5. Jyväskylässä The course will present the capabilities and use of PERCH NMR software by means of lectures and hands-on-tutorials. PERCH is a powerful NMR analysis tool licensed for the Finnish academia. Registration and further details: http://www.csc.fi/csc/kurssit/perch_2007 2.3 DEISA-koulutus CSC:ssä 30.5.-1.6. DEISA-koulutus uusille ja nykyisille infrastruktuurin käyttäjille järjestetään 30.5.~V1.6.2007 CSC:n tiloissa. Koulutuksessa esitellään DEISA:n infrastruktuuria ja väliohjelmistopalveluja sekä käydään läpi DEISA:n yhteistä tuotantoympäristöä ja Unicoren käyttöä. Koulutuksessa on esillä myös käyttäjien kokemuksia. Käytännön "Access to DEISA" -osuudessa on mahdollisuus kokeilla DEISA-infrastruktuuria. Osallistujat saavat kuukauden voimassa olevan DEISA-testikäyttäjä tunnuksen. Koulutukseen otetaan 30 osallistujaa. Muualta Euroopasta tulevien matkakustannuksiin on mahdollista saada tukea DEISA:lta. Lisätietoja: http://www.csc.fi/csc/kurssit/deisatraining 2.4. Summer School on Computational Modeling of Carbohydrates and Proteins in Lipid Membranes will be organized at TKK (Helsinki, Finland), in September 2-3, 2007. It is part of the national graduate school activities incl. the Glycoscience Graduate School, and, thanks to their kind support, it is free of charge. For details of the summer school, see: http://www.fyslab.hut.fi/bio/bio-summerschool-2007/ Menneitä tapahtumia 2.5 MDL Crossfire Training Course 2.4.2007 Kurssin ohjelma on luettavissa verkossa, ja harjoitusmateriaalia voi kysellä suoraan meiltä. http://www.csc.fi/csc/kurssit/arkisto/MDLCrossFire 2.6 Datan käsittely ja analyysi tutkimuksessa, 04.04.2007 Poikkitieteellisen tilaisuuden esitykset luettavissa verkossa: http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/data ----------------------------------------------------------------------- 3. CSC rekrytoi Sunnuntain Helsingin Sanomissa oli ilmoitus, jossa CSC:lle haetaan "Fysiikan ja suurteholaskennan asiantuntijaa" määräaikaiseen työsuhteeseen. Lue lisää www-sivuiltamme: http://www.csc.fi/csc/rekry/avoimet/ Tällä hetkellä haussa myös Linux-asiantuntija, viestinnän moniosaaja ja järjestelmäasiantuntija. ----------------------------------------------------------------------- 4.1 Apurahoja haettavaksi nuorille suomalaisille laskennallisen tieteen tutkijoille Tieteen tietotekniikan keskus CSC julkistaa haettavaksi laskennallisen tieteen edistämiseen tarkoitettuja apurahoja. Suuruudeltaan 5000 - 25000 euron arvoiset apurahat myönnetään nuorille laskennallisen tieteen tutkijoille. Apurahaa sponsoroivat Cray ja AMD. Täydellinen hakuilmoitus löytyy www-sivuiltamme: http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/uutiset/apurahat_2007_3_27 Hakuaika päättyy 30.4.2007 klo 16. 4.2 DEISA:lta resursseja suuriin laskennallisiin hankkeisiin Euroopan supertietokoneinfrastruktuurin, DEISA:n, kerran vuodessa järjestettävä DECI-haku (DEISA Extreme Computing Initiative) suurten laskennallisten hankkeiden ajamiseksi käynnistyy toukokuun alussa. DECI:n tarkoituksena on löytää, mahdollistaa sekä ajaa rajattu määrä laskennallisesti vaativia tai dataintensiivisiä sovelluksia eri tieteen ja teknologian aloilta. Hakemusten viimeinen jättöpäivä on 30.6.2007. DECI-hausta tulee toukokuun alussa lisätietoa CSC:n www-sivulle ja DEISA:n omalle www-sivulle www.deisa.org. CSC:n asiantuntijat auttavat mielellään DECI-hakemuksen laatimisessa. Lisätietoja: Juha Fagerholm, p. (09) 457 2447, s-posti: juha.fagerholm at csc.fi Petri Nikunen, p. (09) 457 2923, s-posti petri.nikunen at csc.fi ----------------------------------------------------------------------- 5. Uudet Lehdet 5.1 @CSC:stä on tullut verkkojulkaisu. Katso verkosta uusin numero (26.3.): http://www.csc.fi/sivut/atcsc/ 5.2 Tietoyhteys (9.3.): http://www.csc.fi/csc/julkaisut/tietoyhteys ----------------------------------------------------------------------- SEURAAVA UUTISKIRJE ilmestyy viikolla 22. ---------------------------------------------------------------------- -- Atte Sillanpää, Application specialist, Chemistry Support CSC - IT Center of Science, Po Box 405, 02101 Espoo, FINLAND TEL +358 9 457 2250, www.csc.fi, email atte.sillanpaa@csc.fi