====================================================================== Chemistry@CSC - nro 3/2009 Sisällys: 0. Hyvää kevättä 1. Printtaa Unix pikaopas (cheat sheet) 2. Uusi CrossFiren käyttöliittymä evaluoitavana 3. Tulevat kurssit ja tapahtumat 4. Ohjelmistouutiset 5. CSC rekrytoi 6. CSC:n lehdet ja muut julkaisut ---------------------------------------------------------------------- 0. Hyvää kevättä! Kevät on jo hyvässä vauhdissa, mutta ennen kesälomia ehtii vielä monelle kurssille, esim. CSC-Primer -kurssille, jossa CSC-ympäristö ja Unixin perusteet käsitellään. Esimakua pikaitseopiskeluna tästä saa Unix cheat sheetista ks. alla. Terveisin CSC:n kemian asiantuntijat: helpdesk@csc.fi Johanna Blomqvist, Nino Runeberg, Atte Sillanpää http://www.csc.fi/chem ----------------------------------------------------------------------- 1. Printtaa Unix pikaopas (cheat sheet) Unixin käyttämisen aloittamista helpottamaan ja konkareiden käyttöä tehostamaan on yhdelle A4:lle koottu peruskomennot ja tärkeimpiä CSC:n ympäristön tietoja. Näillä vinkeillä saat koneista enemmän irti! Lataa kaksipuoleinen A4-pikaopas: http://www.csc.fi/sivut/atcsc/artikkelit/2009/atcsc_1_2009/koneet/cheatsheet ----------------------------------------------------------------------- 2. CrossFire-tietokantojen uuden käyttöliittymätyökalun evaluointi jatkuu Reaxys:iin pääsee tutustumaan toukokuun loppuun saakka. Selaimella pääsee ilman asennuksia hakemaan dataa Beilstein-, Gmelin- ja Patent Chemistry- tietokannoista. Lisätietoja: http://www.csc.fi/english/research/software/crossfire ----------------------------------------------------------------------- 3. Tulevat kurssit ja tapahtumat http://www.csc.fi/csc/kurssit 3.1 EGEE training April 23. at CSC A quick overview of EGEE and gLite middleware and then more focus on Ganga. Registration Deadline tomorrow! Registration and more info: http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/egeetraining09 3.2 Workshop on code optimization and performance tuning on April 20-22 2009. The topics of the course include all the essential considerations for improving the performance and parallle scalability of scientific software. A significant part is reserved for optimizing participants' own applications with the help of CSC's high-performance computing experts. For more information and registration, please visit http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/optimization09 Feel free to distribute this message! 3.3 ADF course 27.-28.4. at CSC, Espoo This course is an introduction to the powerful computational chemistry software Amsterdam Density Functional (ADF). Registration by 23.04.2009: http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/adf09 3.4 PERCH NMR software course in 5.-6.5. in Oulu The course will present the capabilities and use of PERCH NMR software to perform by means of lectures and hands-on-tutorials. Dead line for registration: 26.4.2009 Registration and more information: http://www.csc.fi/csc/kurssit/arkisto/perch_2009 3.5 CrossFire - Search strategies in Commander and in Reaxys Training teaches you search strategies in the current user interface CrossFire® Commander and in new workflow tool Reaxys and includes refined structure, reaction, and data searching. Differences between Commander and Reaxys will also be handled. Lisätietoja ja ilmoittautuminen: http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/crossfire09 3.6 Gaussian workshop suunnitteilla Gaussian workshoppia suunnitellaan pidettäväksi syys-lokakuun vaihteeseen. Käy katsomassa CSC:n Gaussian-sivuilta listaa workshopin mahdollisista aiheista ja lähetä Johannalle (johanna.blomqvist at csc.fi) toiveesi. http://www.csc.fi/english/research/software/gaussian 3.7 Kurssit ja tapahtumat RSS-syötteenä CSC:n kurssi- ja tapahtumailmoituksia voi seurata nyt myös RSS-syötteenä. Rekisteröidy www:ssä: http://www.csc.fi/event_feed Mitä kursseja haluaisit CSC:n järjestävän? Lähetä ehdotuksia kemian asiantuntijoillemme. ----------------------------------------------------------------------- 4 Ohjelmistot 4.1 SOMA2-mallinnusympäristö päivitetty käyttämään Hippua SOMA2:n kautta voi nyt käyttää mm. seuraavia ohjelmistoja Hipulta: CORINA, obprop, ROTATE ja X-Score. Lisäksi mm. seuraavat ohjelmistot ovat käytettävissä Murskalta: AutoDock, Gaussian, GOLD, GPAW, TURBOMOLE. Lisätietoja: http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/asiakastiedotteet/soma2_hippu_20090409 4.2 Turbomolen uusin versio on asennettu Murskaan ja Hippuun Turbomole -ohjelmiston versio 6.01 on asennettu Murskaan ja Hippuun. Asennus sisältää korjatun ridft version. Yhteenveto uusista ominaisuuksista löytyy osoitteesta: http://www.turbo-forum.com/index.php?topic=310.0 Uusimman version saa käyttöön komennolla module load turbomole/6.0 Lisätietoja: http://www.csc.fi/english/research/software/turbomole ----------------------------------------------------------------------- 5. DEISA:n laskentaresurssit haettavana 4.5. asti Eurooppalainen yhteistyöprojekti DEISA jakaa laskentaresursseja Euroopan supertietokoneilta. Hyväksyttyjen hankkeiden tulee sisältää vaativia ja innovatiivisia simulaatioita. Tänä vuonna haussa huomioidaan erityisesti monitieteisiä tai eri maiden välisiä hankkeita. Resursseja on myönnetty vuosittain yli 20 tutkimusprojektille. DECI-haun hakuaika päättyy 4.5.2009. http://www.deisa.eu/science/deci/deci-call-for-proposals2009 ----------------------------------------------------------------------- 6. CSC Rekrytoi CSC hakee tällä hetkellä joukkoonsa sähköposti-, tietoliikenne- ja tietohallintoasiantuntijaa (windows) sekä kesäharjoittelijoita. Lisätietoja: http://www.csc.fi/csc/rekry/avoimet/ ----------------------------------------------------------------------- 7. Uudet Lehdet ja muut julkaisut 7.1 Tieteen tietotekniikka, uusin numero 1/2009 http://www.csc.fi/csc/julkaisut/tieteentietotekniikka/2009/1 7.2 @CSC 1/09 ilmestyy artikkeli kerrallaan Artikkeleita julkaistaan sitä mukaan kun niitä valmistuu, ja neljä kertaa vuodessa ne kootaan 'numeroiksi'. http://www.csc.fi/sivut/atcsc ----------------------------------------------------------------------- SEURAAVA UUTISKIRJE ilmestyy viikolla 22. ----------------------------------------------------------------------