====================================================================== Chemistry@CSC - nro 7/2009 Sisällys: 0. Tehokasta talviaikaa 1. CSC:n asiakaskysely 2. Tulevat kurssit ja tapahtumat 3. Ohjelmistouutiset 4. CSC rekrytoi 5. CSC:n lehdet ja muut julkaisut ---------------------------------------------------------------------- 0. Talviaika tehokäyttöön Parisen viikkoa sitten sirryttiin talviaikaan ja auringonvalon vähentyessä saimme korvaukseksi tunnin lisää. Koko Louhella yksi tunti lisää seinäkelloaikaa olisikin ollut yhteensä 13 kuukautta laskenta-aikaa, mutta ei sitäkään oikein voi muuttaa auringonpaisteeksi. Tehdään nyt sitten tiedettä kaksin käsin! Terveisin CSC:n kemian asiantuntijat: Johanna Blomqvist, Nino Runeberg, Atte Sillanpää http://www.csc.fi/chem ----------------------------------------------------------------------- 1. CSC:n asiakaskysely 2009 päättynyt Kiitokset kaikille CSC:n asiakaskyselyyn vastanneille! Vastauksia tuli yhteensä 263 kappaletta ja niitä analysoidaan parhaillaan. Pääsääntöisesti CSC:n palveluihin on oltu tyytyväisiä ja ne on koettu tutkimuksen kannalta tärkeiksi. Tämä siitä huolimatta, että monessa vastauksessa on mainittu palvelimiamme vaivanneet stabiilisuusongelmat. Analyysin valmistuttua tuloksista tiedotetaan vielä erikseen. Palkinnot vastanneiden kesken on arvottu, ja voittajille ilmoitetaan lähiaikoina. ----------------------------------------------------------------------- 2. Tulevat kurssit ja tapahtumat http://www.csc.fi/csc/kurssit 2.1 CrossFire/Reaxys training course, 11.11.2009 NOTE! The course will be organized as a webinar! User interface program of Beilstein and Gmelin databases will change in autumn 2010. This training teaches you search strategies in the new workflow tool Reaxys and includes refined structure, reaction and data searching. Differences between the current Commander and Reaxys will also be handled. More details: http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/crossfire09Nov 2.2 Introduction to parallel programming with MPI 09.-10.11.2009, CSC The course introduces the basics of parallel programming with the message passing interface (MPI) paradigm. 2.3 Calculating molecular properties with ORCA 12.-13.1.2010 at CSC ORCA is a flexible, reasonably efficient and easy-to-use general purpose tool for quantum chemistry. The workshop teaches how to calculate a number of properties with accurate methods. Registration and more info: http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/orca 2.4 Molecular electronic excitations with Turbomole 14.1.2010 at CSC The workshop will teach the use of accurate but cost effective methods to calculate e.g. optical properties with Turbomole in the CSC environment. No prior experience with Turbomole will be needed. Registration and more info: http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/tm-10 2.5 International Workshop on Coarse-Grained Biomolecular Modeling 7-12th March, in Levi The title workshop is organised by the Computational Soft Matter Group from HUT and supported by CSC and the National Graduate Schools of Materials Physics and Nanosciences. Registration and more information: http://tfy.tkk.fi/soft/levi2010/program.htm 2.5 Kurssit ja tapahtumat RSS-syötteenä CSC:n kurssi- ja tapahtumailmoituksia voi seurata nyt myös RSS-syötteenä. Rekisteröidy www:ssä: http://www.csc.fi/event_feed Mitä kursseja haluaisit CSC:n järjestävän? Lähetä ehdotuksia kemian asiantuntijoillemme. ----------------------------------------------------------------------- 3 Ohjelmistot 3.1 Mitä moduleita Accelrysiin? Ensi vuoden Accelrys-lisenssineuvottelut ovat käynnissä. Viime vuonna vähän tai ei ollenkaan käytettyjä moduleita pudotetaan pois valikoimasta ja uusia voidaan ottaa tilalle. Jos ryhmällänne olisi tarvetta jollekin uudelle modulille, ota yhteyttä Atteen tai Kimmo Mattilaan. http://www.csc.fi/english/research/software/materialsstudio http://www.csc.fi/english/research/sciences/bioscience/programs/ds 3.2 Sybyl-konsortio jatkaa kaudella 2010-2012 Kaikki nykyiset Sybyl-konsortioryhmät jatkavat konsortissa myös kaudella 2010-2012. Konsortiojäsenryhmät saavat käyttöönsä entistä enemmän ohjelmistomoduleita, uutena mm. Pantheonin ja MUSE:n. Uusi Sybyl-X käyttöliittymä on julkaistu. Konsortiojäsenet voivat ladata sen Triposin sivuilta. Lisätietoja: http://www.csc.fi/english/research/software/sybyl 3.3 ISIS/Host tietokantapalvelu päättyy Kolmivuotinen konsortio molekyylitietokannan käytöstä päättyy vuoden lopussa. Tietokantapalvelimen Oracle lisenssi päättyy jo ennen sitä, ja sitä käyttävät toiminnallisuudet (ACD, MDDR ja NCI CSC:n Nitro- palvelimelta) saattavat päättyä jo ennen vuoden vaihdetta. Paikalliset tietokannat kannattaa siirtää toisiin formaatteihin ennen lisenssin päättymistä. Hyvä vaihtoehto on excel-formaatti. Symyx haluaa esitellä korvaavia tuotteitaan kaikille kiinnostuneille. Näistä järjestetään Webinar-tiedotus todennäköisesti kuun lopulla. http://www.symyx.com/ Lisätietoja voi kysyä Atelta. ----------------------------------------------------------------------- 4. CSC Rekrytoi Tällä hetkellä ei ole avoimia hakuja. Lisätietoja: http://www.csc.fi/csc/rekry/avoimet/ ----------------------------------------------------------------------- 5. Uudet Lehdet ja muut julkaisut 5.1 Tieteen tietotekniikka: http://www.csc.fi/csc/julkaisut/tieteentietotekniikka/2009/3 5.2 @CSC ilmestyy artikkeli kerrallaan http://www.csc.fi/sivut/atcsc ----------------------------------------------------------------------- SEURAAVA UUTISKIRJE ilmestyy viikolla 51. ----------------------------------------------------------------------