====================================================================== Chemistry@CSC - nro 2/2008 Sisällys: 0. Hyvää pääsiäistä! 1. Muutoksia laskentaympäristössä 2. Tulevat kurssit ja tapahtumat 3. Ohjelmistouutiset 4. CSC:n lehdet ja muut julkaisut ---------------------------------------------------------------------- 0. Hyvää pääsiäistä ja kevätpäivän tasausta Miehitys kemian palveluissa on vaihtunut: Jussi Ahokas jatkaa tutkijanuralla Jyväskylässä ja Per Harald Jonson CSC:llä. Terveisin CSC:n kemian asiantuntijat Per Harald Jonson, per.harald.jonson@csc.fi Nino Runeberg, nino.runeberg@csc.fi Atte Sillanpää, atte.sillanpaa@csc.fi http://www.csc.fi/chem ----------------------------------------------------------------------- 1. Muutoksia laskentaympäristössä 1.1 Sepeli poistuu yleiskäytöstä 15.4.2008 CSC:n vanhempi superklusteri, sepeli.csc.fi varataan huhtikuun puolivälistä pelkästään ydinfysiikan tutkijoiden käyttöön. Koneella ryhdytään analysoimaan CERNin uuden LHC-törmäyttimen tuottamaa dataa. Muiden käyttäjien tunnukset vanhenevat 15.4.2008. Valtaosa sepelin käyttäjistä on siirtynyt jo CSC:n uudemmille superkoneille Murskaan ja Louheen, joiden suoritusteho on moninkertainen Sepeliin verrattuna. Sepelin käyttäjät voivat saada tunnnuksen Murskaan lähettämällä sähköpostia osoitteeseen usermgr@csc.fi. Sepelin käyttäjien tulee siirtää paikallisilla levyillä työhakemistossa $WRKDIR olevat ohjelmat ja data talteen ennen käyttäjätunnuksen vanhentumista. ----------------------------------------------------------------------- 2. Tulevat kurssit ja tapahtumat http://www.csc.fi/csc/kurssit 2.1 Protein modeling with Discovery Studio 14.-15.4. at CSC The course provides an introduction and overview of the possibilities and options in Discovery Studio. Registration and more info: http://www.csc.fi/csc/kurssit/arkisto/coursepreview.2008-03-10.7378692772 2.2 ARC Grid Middleware Tutorial 8.4. at CSC A hands on tutorial on how to run your jobs in Nordugrid. Registration and more info: http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/ARC200804 2.3 Workshop on HP Performance Tools for Murska Users 23.-25.4. at CSC The worskhop helps to monitor application performance and get detailed information on processor, bus, interconnect, I/O. etc. usage. A part of course time is devoted to analysis of participants own codes. Registration and more info: http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/hpperformancetoolsworkshop ----------------------------------------------------------------------- 3. Uudet ohjelmat ja muita ohjelmistouutisia 3.1 GPAW käytettävissä SOMA2 mallinnusympäristön kautta DFT ohjelmisto GPAW on asennettu Murskalle ja on käytettävissä WWW-käyttöliittymällä SOMA2 mallinnusympäristön kautta. Lisätietoja: http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/asiakastiedotteet/gpaw_soma2-2008-03-13 3.2 SuperStar 1.5.4 on asennettu Murskaan Ohjelman saa käyttöön komennolla "module load ccdc" tai vaihtoehtoisesti Sybylin tai InsightII:n kautta. Lisätietoja: http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/asiakastiedotteet/superstar_154 ----------------------------------------------------------------------- 4. Uudet Lehdet ja muut julkaisut 4.1. Ongelmasta ratkaisuun - kemian mallinnusopas CSC on yhdessä suomalaisten tutkijoiden kanssa laatinut oppaan mallintamisen mahdollisuuksista kemiassa ja lähitieteissä. Opas on ladattavissa verkosta tai tilattavissa maksutta myös painettuna. http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/asiakastiedotteet/kemian_mallinnusopas 4.2 Tietoyhteys 1/2008 on ilmestynyt. http://www.csc.fi/csc/julkaisut/tietoyhteys 4.3 @CSC ilmestyy ensi viikolla http://www.csc.fi/sivut/atcsc ----------------------------------------------------------------------- SEURAAVA UUTISKIRJE ilmestyy viikolla 18. ----------------------------------------------------------------------