====================================================================== Chemistry@CSC - nro 4/2008 Sisällys: 0. Tehokkaita kesän viimeisiä päiviä! 1. Louhi kasvaa, Murskalla levyongelmia 2. Corona poistuu 3. Helpdesk on uudistunut 4. Tulevat kurssit ja tapahtumat 5. Ohjelmistouutiset 6. CSC:n lehdet ja muut julkaisut ---------------------------------------------------------------------- 0. Tehokkaita kesän viimeisiä päiviä! Terveisin CSC:n kemian asiantuntijat Johanna Blomqvist, johanna.blomqvist@csc.fi Nino Runeberg, nino.runeberg@csc.fi Atte Sillanpää, atte.sillanpaa@csc.fi http://www.csc.fi/chem ----------------------------------------------------------------------- 1. Louhi päivitetään yli kaksinkertaiseksi syyskuussa 1.1 Louhen tehoksi 86,7 Tflop/s * Arviolta neljän viikon katko muuton ja päivityksen vuoksi * Huoltokatko alkaa 11.9. * Louhelle saa nyt ajoon pienempiäkin töitä! (32 ydintä) Lisää laajennuksesta: http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/asiakastiedotteet/louhiupgrade3_09-208 Louhelle saat käyttäjätunnuksen lähettämällä mailia usermgr@csc.fi http://www.csc.fi/tutkimus/Laskentapalvelut/laskenta/palvelimet/louhen_skaalautuvuustestit 1.2 Murskalla levyongelmia Viimeaikoina Murskalla on ollut useita levyongelmia. Ongelmat olivat seurausta yhteistyökumppanin laitetiloissa tapahtuneesta jäähdytysongelmasta. Pahoittelemme tästä johtunutta huoltokatkoa. Lisää aiheesta: http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/katkot/tiedote?uid=d69cade38c8255840aa310dab64deb33 1.3 Murskalla myös lyhyt katko 15.9. NFS-levyjärjestelmää tehostetaan. Tämä aiheuttaa lyhyen katkon interaktiivisessa käytössä, mutta erätyöt, jotka tarvitsevat vain wrk-aluetta jatkuvat keskeytyksittä. Lisätietoja: http://www.csc.fi/csc/ajankohtaista/katkot/tiedote?uid=a25d6f06cb29fffd1f78c227100dfffc 1.4 Oikea paikka tiedostoille Tiedostoja ei pidä säilyttää pitkiä aikoja $WRKDIR hakemistoissa. Hyvä säilytyspaikka on $ARCHIVE. Sinne kannattaa tallettaa vain suuria tiedostoja. tar-komennolla saat kätevästi pakattua esimerkiksi koko hakemiston yhdeksi tiedostoksi, jolloin se siirtyy nopeammin ja vie vähemmän tilaa. Usein se kannattaa lisäksi vielä tiivistää gzip -komennolla. tar cf my_work_folder_files.tar work_folder gzip my_work_folder_files.tar gzipatun tar.gz-tiedoston saa purettua komennolla tar zxf my_work_folder_files.tar.gz Lisää ohjeita CSC:n levyjärjestelmien käytöstä: http://www.csc.fi/tutkimus/tallennus/ ----------------------------------------------------------------------- 2. Corona-laitteisto poistuu ensi vuoden alkupuolella CSC on käynnistänyt uuden koneen hankinnan Coronan tilalle. Puolet Coronasta on jo päästetty lepoon, ja toinen puoli jatkaa palveluaan uuden koneen käyttöönottoon saakka. Coronan poistumisesta tullaan tiedottamaa lisää aikataulujen tarkentuessa. ----------------------------------------------------------------------- 3. Helpdesk siirtynyt käyttämään RT-tikettijärjestelmää Ottaessasi yhteyttä helpdeskiin (helpdesk@csc.fi) saat vastaukseksi sähköpostin, jonka otsikossa on RT-tikettinumero esim. [CSC #9742] Käytä sähköpostiohjelman vastaa (reply) -toimintoa, jolloin otsikon tikettinumero ohjaa postit oikeaan osoitteeseen. Helpdesk on hyvä tapa ottaa yhteyttä CSC:n asiantuntijoihin, koska yksittäisen asiantuntijan ollessa lomalla, voidaan pyyntö ohjata paikalla olevalle henkilölle. ----------------------------------------------------------------------- 4. Tulevat kurssit ja tapahtumat http://www.csc.fi/csc/kurssit 4.1 CSC Primer 17.09.2008 09:15 - 15:00 Short introduction to linux, unix and shell that are used in the CSC environment. Registration by 12.09.2008. http://www.csc.fi/english/csc/courses/archive/cscprimer_2008 4.2 PERCH NMR-course at CSC 13.-14.10.2008 Registration by 26.09.2008. http://www.csc.fi/csc/kurssit/arkisto/perch_2008 4.3 Protein modeling with Discovery Studio 20.-21.11. 2008 Registration by 14.11.2008. http://www.csc.fi/csc/kurssit/arkisto/DS_kurssi_2_2008 4.4 Crossfire-kurssi tulossa syksyllä 2008 4.5 Kurssit ja tapahtumat RSS-syötteenä CSC:n kurssi-ja tapahtumailmoituksia voi seurata nyt myös RSS-syötteenä. Rekisteröidy www:ssä: http://www.csc.fi/event_feed ----------------------------------------------------------------------- 5. Uudet ohjelmat ja muita ohjelmisto- ja tietokantauutisia 5.1 CrossFire-tietokantapalvelimen domain-nimet muuttuivat 30.9.2008 Lisätietoja instituutionne CrossFire-kontaktihenkilöltä ja CSC:n CrossFire-sivuilta: http://www.csc.fi/english/research/software/mdl_crossfire ----------------------------------------------------------------------- 6. Uudet Lehdet ja muut julkaisut 6.1 @CSC 3/08 ilmestyy ensi perjantaina http://www.csc.fi/sivut/atcsc ----------------------------------------------------------------------- SEURAAVA UUTISKIRJE ilmestyy viikolla 42. ----------------------------------------------------------------------